在Linux下使用旧版本R包的安全方法[关闭]

iaqfqrcu 于 2023-11-14 发布在 Linux

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有时候我需要运行一些旧的R代码，这些代码是我以前用的包版本，而不是我现在用的R版本。当我不需要用当前包的新函数更新和纠正脚本时，只是检查这些脚本的结果，什么是更安全的方法？直到我知道我发现了两种可能性。
1.安装多个R版本及其相关的“旧”包，并根据需要从一个版本转换到另一个版本，如果可能的话，可以从rstudio。
1.只有一个R版本（假设这是一个相对较新的版本），并在需要时使用旧软件包，以防使用旧软件包时出现依赖性问题。
第一个选择对我来说是一场灾难，因为我试图以不同的方式安装其他版本的R，还必须“调整”我的Debian发行版（靶心）接受最新的R版本，它变得不稳定，最后我不得不格式化我的PC.相关问题here和here，但在尝试建议的解决方案之前，我想知道是否有其他的选择。所以我会很感激任何关于用旧的包/函数运行旧脚本的更容易和更安全的方法的见解。

r

来源：https://stackoverflow.com/questions/77453851/a-safe-way-to-use-older-versions-of-an-r-package-under-linux

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按热度按时间

a1o7rhls1#

这很好地利用了R使用不同库路径的能力。您可以通过.libPaths()轻松设置这些路径。
作为一个具体的例子，我碰巧喜欢使用roxygen2版本6.0.1。所以我把它放在一个我的“正常”R安装不知道的目录中。在一个帮助脚本中（我也喜欢从命令行使用它），我然后这样做。

if (dir.exists("~/.R/cache/roxygen2")) {
    cat("** Using cached version 6.0.1 of roxygen2.\n")
    .libPaths("~/.R/cache")
}

## load roxygen
library(roxygen2)

字符串
并且在存在该目录的机器上，它将被前缀到库路径，并且在该会话中使用较旧的roxygen版本。
你可以很容易地概括这一点，我们已经为持续集成和其他用例做了这样的工作。
另一个例子是 e.g. 由我使用r-devel提供的，因为它有自己的库路径（这样我就可以让r-devel编译包，然后是系统编译包（这样我就不必重新构建所有包））：

$ RD -q -e '.libPaths()'
> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R-devel/lib/R/library" 
[2] "/usr/local/lib/R/site-library"       
> 
$

型

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