要删除未使用的css代码，您有多种选择：
1.使用Bootstrap v3 customizer
1.编译您需要的.scss/.less组件（v4或v3）
1.使用uncss（选中using uncss with Bootstrap）
要删除未使用的js代码，您也有多个选项：

1. Google的Closure Compiler（启用ADVANCED_OPTIMIZATIONS）
2. UglifyJS2（带dead_code选项）
3. Dead Javascript Eliminator

你可以使用gulp-purgecss在gulp环境中删除你未使用的css。
更多的解释，看看这个DEMO和阅读它的文档。