我正在用不同的轴范围绘制几个不同的图,所以这个问题不仅仅适用于我在这里展示的代码。我试图修改刻度线的中断和间隔,但对于一些图,y轴总是在最后一个中断之后继续。但对于一些图,它只是像this一样工作正常。
下面是我当前的绘图和代码。我想在y轴上以60结束:
的数据
# Set nucleotide sequence for x-axis labels
my_labs = c("C", "T", "A", "C", "A", "T", "A", "A", "A", "T", "A", "C", "A", "C", "A", "T", "G", "T", "C", "T", "C", "T", "G", "C", "T", "C", "G", "T", "T", "C", "G", "G", "G", "G", "G", "C", "C", "G", "G", "T", "A", "T", "G", "C", "T", "A", "C", "A", "C", "G", "G", "A", "A", "C", "G", "T", "G", "A", "G", "A", "G", "A", "C", "C", "C", "C", "T", "C", "G", "G", "A", "A", "C", "T", "G", "G", "C", "A", "T", "A", "G", "A", "C", "T", "T", "G", "T", "G", "T", "A", "T", "A", "A", "A", "A", "G", "A", "A", "T")
# Set color of each nucleotide
my_cols = c("Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Red", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Blue", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black", "Black")
ggplot(data = miRNA2) +
geom_line(mapping = aes(x = Position, y = CPM), colour="red") +
scale_y_continuous(breaks = seq(0, 60, 10)) +
ylab("Counts per million") +
scale_x_continuous(breaks=1:99, labels=my_labs, expand = c(0, 0)) +
theme(axis.text.x = element_text(color = my_cols, family = "Courier", size = 6),
panel.grid.minor.x=element_blank(), panel.grid.major.x=element_blank(), panel.grid.minor.y=element_blank(), panel.background = element_blank(),
axis.line = element_line(colour = "black")) +
xlab("Supercontig_1.420:40270-40368") +
ggtitle("Sar-Mir-Nov-2") +
theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5))
字符串
3条答案
按热度按时间xj3cbfub1#
只需将
limits = c(0,60)
和expand = c(0,0)
添加到scale_y_continuous
:字符串
btxsgosb2#
你是否想设置ylim max,使最后一个断点四舍五入到最接近的10,以及所有的断点都以10为增量?
你可以通过抓取gg对象
ggplot_build(gg)$layout$panel_ranges[[1]]$y.range
的y范围来获得ggplot的当前ylim,并将ylim max的ceiling取到最接近的10,同样地设置你的breaks。这样你就可以根据图动态地设置限制和breaks。字符串
请尝试这个,我没有你的数据,所以我不能告诉它是否为你工作。
型
为了限制的冗余而编辑,代码现在应该是正确的。
mgdq6dx13#
这将自动设置中断和限制,并确保中断的步长为10乘以1、2或5的某个幂(而不是3或2.5像有时发生的ggplot的自动休息),它绘制的情节线超过面板边界,而不是反之亦然(因此,如果有一条线与y轴的端点具有相同的值,那么这条线的一半不会被切断):
字符串
的数据