如何自定义最小和最大顶点大小时，打印igraph对象和创建图例在选定的顶点大小

y1aodyip 于 11个月前发布在其他

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下面是一个有10个顶点的igraph对象，每个顶点都被分配了两种颜色中的一种。我想绘制这个图，顶点的大小随一个名为val的变量而变化，这个变量是一个长度为10的向量，范围从1到10，对应于图中的10个顶点。

library(igraph)

g <- make_ring(10)

val = 1:10
pal <- c("pink", "steelblue")
V(g)$color <- c(rep("pink", 5), rep("steelblue", 5))

pdf("aa.pdf", width = 7, height = 7)
plot(g, layout = layout_with_fr, 
     vertex.size = val, cex = 0.5,
     vertex.frame.color = NA, edge.color = adjustcolor("#c7c7c7", alpha.f = 0.9))
legend(-1.3, -0.9, legend = val, 
       pch = 21, 
       pt.bg = pal, # Color of filled legend
       col = pal, # Color of legend symbol border
       bty="n", #Remove legend border
       # horiz = T, 
       ncol = 5
       )
dev.off()

字符串
下面是输出图：

如果我理解正确的话，图中第10个顶点的大小是val[10]，也就是10。图中第一个顶点的大小是val[1]，也就是1。Q1：如何自定义顶点的大小，使顶点大小仍然按val变化，但最大的顶点大小（即，第10个顶点）用点大小15绘制，并且最小顶点大小（即，第一个顶点）用点大小2绘制，并且其他顶点大小相应地以某种方式在2和15之间缩放？

第二季度：另外，如何创建一个**黑色（非彩色）**点的图例，仅显示val值为1、4、8和10的顶点的大小？

r

来源：https://stackoverflow.com/questions/77638252/how-to-customize-the-min-and-max-vertex-size-when-plot-igraph-object-and-create

1条答案

按热度按时间

pcww981p1#

使用tidygraph/ggraph生态系统，这种级别的自定义要容易得多：

library(igraph)
library(tidygraph)
library(ggraph)

make_ring(10) %>%
  as_tbl_graph() %>%
  mutate(val = 1:10, color = rep(c('pink', 'steelblue'), each = 5)) %>%
  ggraph() +
  geom_edge_link() +
  geom_node_point(aes(size = val, fill = color), shape = 21) +
  geom_node_text(aes(label = val)) +
  scale_fill_identity() +
  scale_size_area(max_size = 15, breaks = c(1, 4, 8, 10),
                  guide = guide_legend(override.aes = list(fill = 'black'))) +
  coord_equal(clip = 'off') +
  theme_graph() +
  theme(legend.position = 'bottom')

字符串
x1c 0d1x的数据

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