我试图在一个seurat对象上运行Doubletterfly，该对象是由各种数据的集成产生的。
完整的seurat对象已完全处理：
1.规范化和FindVariableFeature预集成
1.集成对象上的ScaleData、RunPCA、FindNeighbors、FindClusters、RunUMAP。
然而，当我运行时，DoubletNode的paramSweep_v3（）函数给我一个错误，即使DoubletFinder成功安装和加载[ library(DoubletFinder) ]：
sweep.res.list_pbmc <- paramSweep_v3(data.seurat.filtered, PCs = 1:20, sct = FALSE)
Error in paramSweep_v3(data.seurat.filtered, PCs = 1:20, sct = FALSE) :
could not find function "paramSweep_v3"字符串
如何让DoubletTable paramSweep_v3功能正常工作？
1条答案
按热度按时间xxe27gdn1#
在旧版本的DoubletHub中，
paramSweep适用于我，如下所示;字符串
但是，您始终可以从repository下载任何特定函数，并将其包含在现有包中。