我同意这个观点。

有人找到解决这个问题的方法了吗？

解析器不会将')'作为括号进行转义，而是只考虑'',然后关闭(组成)节点。
解决方法：将所有出现的')'和'('分别替换为'-LRB-'和'-RRB-':

s = '(S \))'
s = s.replace('\)', '-LRB-').replace('\(', '-RRB-') # fix
Tree.fromstring(s)

当前的正则表达式只允许非空白字符，且这些字符不等于用于指定节点和叶子的括号。@yetanotheryeti 的解决方法可能是一个好办法。也许可以在应用正则表达式之前识别、去除或标记转义的括号，然后在解析树之后重新引入。

在最佳情况下，输入中的 \) 应保持为输出中的 \),即不是像 -RRB- 这样的一个令牌。此外，最好不要像保留一些输入(如 -RRB-)作为影响程序行为的令牌那样，需要预留一些输入。我的意思是，对于不了解函数内部工作原理的用户来说，他们不应该随机地将恰好为 -RRB- 的令牌转换为 \)。

我已经将此问题标记为要解决的第一个好问题。希望这能引起更多人的关注。